Gara

Partite

 Andata
15-16/7/2008

Ritorno
22-23/7/2008

1 Linfield (Irlanda del Nord) - Dinamo Zagabria (Croazia) 0-2 1-1
2 Valletta (Malta) - Artmedia Petrzalka (Slovacchia) 0-2 0-1
3 Dinamo Tbilisi (Georgia) - NSI Runavik (Far Oer) 3-0 0-1
4 Santa Coloma (Andorra) - Kaunas (Lituania) 1-4 1-3
5 Murata (San Marino) - Goteborg (Svezia) 0-5 0-4
6 Llanelli (Galles) - Ventspils (Lettonia) 1-0 0-4
7 Anorthosis Famagosta (Cipro) - Pyunik (Armenia) 1-0 2-0
8 Inter Baki (Azerbaijan) - Rabotnicki (Macedonia) 0-0 1-1
9 Tampere Utd (Finlandia) - Buducnost Podgorica (Montenegro) 2-1 1-1
10 Dudelange (Lussemburgo) - Domzale (Slovenia) 0-1 0-2
11 Dinamo Tirana (Albania) - Modrica (Bosnia/Erzegovina) 0-2 1-2
12 Aktobe (Kazakhstan) - Sheriff (Moldavia) 1-0 0-4
13 Drogheda (Repubblica d'Irlanda) - Levadia Tallin (Estonia) 2-1 1-0
14 Bate Borisov (Bielorussia) - Valur Reykjavik (Islanda) 2-0 1-0
Ottavi di finale - Andata
Ottavi di finale - Ritorno