Partite	Andata 26/27-07-11	Ritorno 02/03-08-11
Litex Lovech (Bulgaria) - Wisla Cracovia (Polonia)	1-2	1-3
Maccabi Haifa (Israele) - Maribor (Slovenia)	2-1	1-1
HJK Helsinki (Finlandia) - Dinamo Zagabria (Croazia)	1-2	0-1
Apoel Nicosia (Cipro) - Slovan Bratislava (Slovacchia)	0-0	2-0
Copenaghen (Danimarca) - Shamrock (Irlanda)	1-0	2-0
Genk (Belgio) - Partizan Belgrado (Serbia)	2-1	1-1
Rosenborg (Norvegia) - Viktoria Plzen  (Rep. Ceca)	0-1	2-3
Zestafoni (Georgia) - Sturm Graz (Austria)	1-1	0-1
Rangers Glasgow (Scozia) - Malmo (Svezia)	0-1	1-1
Ekranas (Lituania) - Bate Borisov (Bielorussia)	0-0	1-3
La squadra in grassetto accede al turno successivo

Partite	Andata 26/27-07-11	Ritorno 02/03-08-11
Standard Liegi (Belgio) - Zurigo (Svizzera)	1-1	0-1
Twente Enschede (Olanda) - Vaslui (Romania)	2-0	0-0
Benfica (Portogallo) - Trabzonspor (Turchia)	2-0	1-1
Dinamo Kiev (Ucraina) - Rubin Kazan (Russia)	0-2	1-2
Odense (Danimarca) - Panathinaikos (Grecia)	1-1	4-3
La squadra in grassetto accede al turno successivo